RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIAP1	O43715	76 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	PYY	P10082	97 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	CD226	Q15762	336 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483		Q56UQ5	140 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	OR51H1	Q8NH63	302 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	MYH8	P13535	1937 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	CD55	P08174	381 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	SSR2	P43308	183 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	H2BFS	P57053	126 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	WFDC2	Q14508	124 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	GAGE13	Q4V321	117 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	OTOS	Q8NHW6	89 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	PIFO	Q8TCI5	191 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	MAL2	Q969L2	176 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	CKAP5	Q14008	2032 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	DCC	P43146	1447 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	LYPD3	O95274	346 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	CCL1	P22362	96 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	PPIC	P45877	212 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM187	Q14656	261 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	OR7A5	Q15622	319 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	AAED1	Q7RTV5	226 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF14	Q15058	1648 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C8orf87	E5RJ46	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ERVK-16	P61578	105 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF345	Q14585	488 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC00303	Q3SY05	128 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PDF	Q9HBH1	243 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TTC3	P53804	2025 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ATP1B1	P05026	303 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	INSL3	P51460	131 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483		Q6ZWC4	215 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	CKLF	Q9UBR5	152 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	RRH	O14718	337 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NMU	P48645	174 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	BAGE3	Q86Y29	109 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	BAGE2	Q86Y30	109 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	AMELY	Q99218	206 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	VGLL1	Q99990	258 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	AICDA	Q9GZX7	198 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	NUP205	Q92621	2012 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF253	O75346	499 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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