RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4A5Q8NH83 315 aa6.78□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.78□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 GALNT14Q96FL9 552 aa6.78□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2A7Q96R45 310 aa6.78□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 P2RX4Q99571 388 aa6.78□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 GON7Q9BXV9 100 aa6.78□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.78□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFP57Q9NU63 452 aa6.78□□□□□ -1.32
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CLSTN3-212ENST00000541770 ATP6V0E1O15342 81 aa6.77□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 SERPINE2P07093 398 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 MAS1LP35410 378 aa6.77□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 DEFB136Q30KP8 78 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.77□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM230Q96A57 120 aa6.77□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 CLCC1Q96S66 551 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 NAA60Q9H7X0 242 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.77□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 UPK2O00526 184 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 KRASP01116 189 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 IGHG4P01861 327 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1D-39P04432 117 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5AC1P0C628 307 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 OR4A47Q6IF82 309 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.76□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 TENM2Q9NT68 2774 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 ELANEP08246 267 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 AKR1C4P17516 323 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 G6PCP35575 357 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLSTN3-212ENST00000541770 TNXAQ16473 311 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SP6Q3SY56 376 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 TEX38Q6PEX7 206 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 RNF152Q8N8N0 203 aa6.75□□□□□ -1.33
CLSTN3-212ENST00000541770 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.75□□□□□ -1.33
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