RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHST1O43916 411 aa6.77□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CA2P00918 260 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGF2P09038 288 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VAMP2P63027 116 aa6.77□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.77□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR52E5Q8NH55 327 aa6.77□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED13LQ71F56 2210 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MSGN1A6NI15 193 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.76□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGF16O43320 207 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNGR2O43760 224 aa6.76□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CX3CL1P78423 397 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.76□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF429Q86V71 674 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM86BQ8N661 226 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5B3Q8NH48 314 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DTD1Q8TEA8 209 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.76□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.76□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.76□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 E5RGE8 158 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR137BO60478 399 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRLF1O75462 422 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEDDO75618 318 aa6.75□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AARDQ4LEZ3 155 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.75□□□□□ -1.33
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF126Q9BV68 326 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARP11Q9NR21 331 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSENENQ9NZ42 101 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MBD2Q9UBB5 411 aa6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOTCH2Q04721 2471 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 E7EUB6 86 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H0YIZ8 118 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNA10P01566 189 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMY1AP04745 511 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.332e-6■□□□□ 8.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM157CP0CG43 387 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR13C7P0DN81 318 aa6.74□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A4P12235 298 aa6.74□□□□□ -1.33
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