RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 Q8N9W7 124 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CYGBQ8WWM9 190 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FAM46BQ96A09 425 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 RFT1Q96AA3 541 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR4C12Q96R67 309 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SPIN2AQ99865 258 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 THYN1Q9P016 225 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 RAB22AQ9UL26 194 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.24□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 A6NIN4 97 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf77C9JDV5 145 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 F8VVB4 439 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 F8VWA3 439 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 H7C2Y5 167 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SLC17A2O00624 439 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR2A4O95047 310 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CDRT1O95170 752 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 NAPSAO96009 420 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CD3GP09693 182 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CD37P11049 281 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 IGLL1P15814 213 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GNB3P16520 340 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TALDO1P37837 337 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CBX5P45973 191 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GNG10P50151 68 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 RAB9AP51151 201 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP10-3P60369 221 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GABARAPL2P60520 117 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ACTBP60709 375 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DRB3P79483 266 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 RAB11BQ15907 218 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PIGYQ3MUY2 71 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ACTBL2Q562R1 376 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 Q8N402 240 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LRTM2Q8N967 370 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR4A5Q8NH83 315 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C17orf50Q8WW18 174 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 KCTD7Q96MP8 289 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SPACA5Q96QH8 159 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 U3KQK5 164 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 COL7A1Q02388 2944 aa3.23□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TRDCB7Z8K6 153 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 I3L521 148 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 M0R129 80 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 DFFBO76075 338 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ATG12O94817 140 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CNIH1O95406 144 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HRASP01112 189 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SPP1P10451 314 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ETV1P50549 477 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CATR1Q13166 79 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 AHSA2Q719I0 299 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms