RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 SETD5Q9C0A6 1442 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 LST1O00453 97 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 MSMBP08118 114 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 IL3P08700 152 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP1R1AQ13522 171 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 C10orf55Q5SWW7 151 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM78BQ5VT40 261 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 DNAJB3Q8WWF6 145 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 GLI3P10071 1580 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ERICH2A1L162 156 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM25EA8MYX2 175 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 F5H768 121 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 I3L521 148 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 KRT75O95678 551 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 NPPAP01160 153 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 UBBP0CG47 229 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 HLA-DMBP28068 263 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CSN1S1P47710 185 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 DEFB115Q30KQ5 88 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 GID4Q8IVV7 300 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TBC1D19Q8N5T2 526 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 JOSD2Q8TAC2 188 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCTD7Q96MP8 289 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 DHRS9Q9BPW9 319 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 NDEL1Q9GZM8 345 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPACA1Q9HBV2 294 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 AK3Q9UIJ7 227 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 BAIAP2Q9UQB8 552 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 IRGMA1A4Y4 181 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 COCHO43405 550 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CALUO43852 315 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SULT1A3P0DMM9 295 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SULT1A4P0DMN0 295 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 RAB13P51153 203 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 UBE2G2P60604 165 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF345Q14585 488 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM251Q8N6I4 163 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ANKRD7Q92527 254 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 DKKL1Q9UK85 242 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 POLR1DQ9Y2S0 133 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM212A6NML5 194 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 OR4C45A6NMZ5 311 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 KRT7P08729 469 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 S100A7P31151 101 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 REG1BP48304 166 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 FXYD2P54710 66 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 OR4D2P58180 307 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF846Q147U1 533 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 HIST2H3AQ71DI3 136 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 Q8N402 240 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF565Q8N9K5 539 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 OR5B17Q8NGF7 314 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SNURFQ9Y675 71 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 PXMP4Q9Y6I8 212 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 LAMB4A4D0S4 1761 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAST2Q6P0Q8 1798 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 STRCQ7RTU9 1775 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ITGB1BP1O14713 200 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC22A1O15245 554 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 PMP2P02689 132 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 HAAOP46952 286 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CST9Q5W186 159 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 C5orf46Q6UWT4 87 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 YIPF3Q9GZM5 350 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAP1LC3AQ9H492 121 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRABDQ9H4I3 376 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 DISC1C4P0D8 188 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 GOLGA8KD6RF30 607 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 GOLGA8MH3BSY2 632 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 YEATS4O95619 227 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 IGHV3-7P01780 117 aa0.42□□□□□ -2.34
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