RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM109Q9BVC6 243 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCC12Q96J65 1359 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CD7P09564 240 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 MYL12AP19105 171 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ITFG2Q969R8 447 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R14BQ96C90 147 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 OPTNQ96CV9 577 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 OR8B2Q96RD0 313 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.01□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 JOSD2Q8TAC2 188 aa4□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 LAMB2P55268 1798 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 SSC5DA1L4H1 1573 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM208BQ5VWN6 2430 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 IGLV6-57P01721 117 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CCR7P32248 378 aa3.99□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 OR8K1Q8NGG5 319 aa3.99□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 STACQ99469 402 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 OR51I1Q9H343 314 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 HHLA2Q9UM44 414 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 MED23Q9ULK4 1368 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ATAD5Q96QE3 1844 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 MT-CO2P00403 227 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CDKN2CP42773 168 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 LAMB1P07942 1786 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 ESDP10768 282 aa3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 TVP23CQ96ET8 276 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1B-205ENST00000514178 NUP98P52948 1817 aa3.97□□□□□ -1.77
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PGGT1B-205ENST00000514178 ALPK3Q96L96 1907 aa3.96□□□□□ -1.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CDK9P50750 372 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TAS2R45P59539 299 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP10-8P60410 259 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SBSNQ6UWP8 590 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 OR51I2Q9H344 312 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SHROOM3Q8TF72 1996 aa3.96□□□□□ -1.78
PGGT1B-205ENST00000514178 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.96□□□□□ -1.78
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