RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	SPIN2A	Q99865	258 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PRRT1	Q99946	306 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	MARCH11	A6NNE9	402 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148		H3BUA1	57 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148		I3L521	148 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	MPPED1	O15442	326 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF735	P0CB33	412 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ETV6	P41212	452 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	RAB9A	P51151	201 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF79	Q15937	498 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148		Q8N402	240 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR11H1	Q8NG94	326 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	TRIM63	Q969Q1	353 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	FGF2	P09038	288 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	PIGP	P57054	158 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	TPPP2	P59282	170 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	AP3S2	P59780	193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM140	Q9NV12	185 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	VSIG4	Q9Y279	399 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	HLA-G	P17693	338 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	PI3	P19957	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	LPAR6	P43657	344 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR5B12	Q96R08	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	COPZ2	Q9P299	210 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148		H0Y980	276 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	BRI3	O95415	125 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	TRGV3	P03979	118 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR9G9	P0C7N8	305 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	APELA	P0DMC3	54 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	RUNX1	Q01196	453 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF585B	Q52M93	769 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	CADM3	Q8N126	398 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR5T1	Q8NG75	326 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	MCUB	Q9NWR8	336 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	COA4	Q9NYJ1	87 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	UPK2	O00526	184 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	KRAS	P01116	189 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SERPINE2	P07093	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	RPA2	P15927	270 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	DCUN1D4	Q92564	292 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	MS4A10	Q96PG2	267 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SRR	Q9GZT4	340 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	B3GALNT1	O75752	331 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	OR8U8	P0C7N1	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	G6PC	P35575	357 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF616	Q08AN1	781 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0G2JLM5	398 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	TEX22	C9J3V5	150 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	SNAPC5	O75971	98 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	LY86	O95711	162 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	SLURP1	P55000	103 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
MIB2-223	ENST00000508148	TP53RK	Q96S44	253 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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