RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.59□□□□□ -1.67
ARHGEF3-215ENST00000498517 HES4Q9HCC6 221 aa4.59□□□□□ -1.67
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.59□□□□□ -1.67
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.59□□□□□ -1.67
ARHGEF3-215ENST00000498517 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ARHGEF3-215ENST00000498517 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.59□□□□□ -1.67
ARHGEF3-215ENST00000498517 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.59□□□□□ -1.67
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.59□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 B4DEV8 164 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 C12orf77C9JDV5 145 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 AP4M1O00189 453 aa4.58□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 IGHV2-5P01817 119 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 GYPAP02724 150 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.58□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 COL10A1Q03692 680 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC38A11Q08AI6 406 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.58□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR1L1Q8NH94 360 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBALD1Q8TB05 177 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 NINJ1Q92982 152 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 GALMQ96C23 342 aa4.58□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBKSQ9H477 322 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHODLQ9H9P2 273 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB9BQ9NP90 201 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPRMQ9NS64 109 aa4.58□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 GNG13Q9P2W3 67 aa4.58□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB29O14966 203 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TGOLN2O43493 480 aa4.57□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 P0C879 139 aa4.57□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NQO2P16083 231 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 NDUFB7P17568 137 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 GZMHP20718 246 aa4.57□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GLIPR1P48060 266 aa4.57□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB11AP62491 216 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNFRSF9Q07011 255 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARL16Q0P5N6 197 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 PMS2P11Q13670 270 aa4.57□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF726P1Q15940 193 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.57□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCN15Q6UWW0 184 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 FGFRL1Q8N441 504 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 NANPQ8TBE9 248 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 LURAP1Q96LR2 239 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR4C12Q96R67 309 aa4.57□□□□□ -1.68
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RSG1Q9BU20 258 aa4.57□□□□□ -1.68
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.57□□□□□ -1.68
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