RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CMTM3Q96MX0 182 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR2C1O95371 312 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RLN1P04808 185 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTRB1P17538 263 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HRH1P35367 487 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RORCP51449 518 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR2B8PP59922 312 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERVK-16P61578 105 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POU2AF1Q16633 256 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCN12Q6JVE5 192 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q8N402 240 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPX8Q8TED1 209 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZMAT4Q9H898 229 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM140Q9NV12 185 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 S4R3C0 116 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CGB1A6NKQ9 187 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 F2RP25116 425 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LPAR6P43657 344 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TSPAN5P62079 268 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RCHY1Q96PM5 261 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COMMD9Q9P000 198 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IZUMO1RA6ND01 250 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR31O00270 319 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HPGDSO60760 199 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ELK1P19419 428 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARL3P36405 182 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MZT2AQ6P582 158 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM25AB3EWG3 89 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM25CB3EWG5 89 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM25GB3EWG6 89 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR2K2Q8NGT1 345 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MARCH11A6NNE9 402 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A8MZ25 164 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRASP01116 189 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 S100GP29377 79 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KLK9Q2XQG4 91 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPHB5Q86YW7 130 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CXorf58Q96LI9 332 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC140Q96MF4 163 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TUBA4BQ9H853 241 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF320A2RRD8 509 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C2orf70A6NJV1 201 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LGALS9O00182 355 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNAPC5O75971 98 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLEC3BP05452 202 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FGF2P09038 288 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FOLR2P14207 255 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RCVRNP35243 200 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 G6PCP35575 357 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AP3S1Q92572 193 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HINT2Q9BX68 163 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 THYN1Q9P016 225 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYB5BO43169 146 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMIM18P0DKX4 95 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR13C7P0DN81 318 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEFB114Q30KQ6 69 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF585BQ52M93 769 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR107Q5VW38 600 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NSG2Q9Y328 171 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EDN2P20800 178 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms