RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478044.1

CUL2-208, Transcript of cullin 2, human

TSL 3

Gene CUL2, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044		A0A1W2PN81	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044		M0QZ24	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	HPRT1	P00492	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	IGF1	P05019	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	NQO2	P16083	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	F2R	P25116	425 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	G6PC	P35575	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	CHRNA7	P36544	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	SLURP1	P55000	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	AP3S2	P59780	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	ERVK-16	P61578	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	CD83	Q01151	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF45	Q02386	682 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	PRRT1	Q99946	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	VWF	P04275	2813 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67	4e-6	■■■■□ 20.5
CUL2-208	ENST00000478044	SOX15	O60248	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	KBTBD11	O94819	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	PRH1	P02810	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	IL7	P13232	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	AKR1C4	P17516	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	HLA-G	P17693	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	CCR6	P51684	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TAS2R31	P59538	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	DEFA5	Q01523	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUL2-208	ENST00000478044	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044		E7EUB6	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044		H0Y980	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	UPK2	O00526	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUL2-208	ENST00000478044	SNAPC5	O75971	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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