RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 SPIN2AQ99865 258 aa5.82□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.82□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.82□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.82□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 BET1LQ9NYM9 111 aa5.82□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 FCGR3BO75015 233 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ACTL6BO94805 426 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 KBTBD11O94819 623 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 OR2A4O95047 310 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 HPRT1P00492 218 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ELK1P19419 428 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 S100GP29377 79 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 HERV-K104P61576 105 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 LFNGQ8NES3 379 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 OR2A7Q96R45 310 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 EHFQ9NZC4 300 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.81□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 PKHD1P08F94 4074 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 FAM223BA6NKX1 122 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 CTDSPLO15194 276 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 CNIH1O95406 144 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 NQO2P16083 231 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ZP3P21754 424 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 29.2
RBBP4-211ENST00000477563 GNRHRP30968 328 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00205P59089 165 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.8□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 GABARAPH6UMI1 98 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 GPR31O00270 319 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 HPGDSO60760 199 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 B3GALNT1O75752 331 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 DHFRP00374 187 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 IGHV3-11P01762 117 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 CRYGCP07315 174 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 OR9G9P0C7N8 305 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF735P0CB33 412 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 RPA2P15927 270 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 F2RP25116 425 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 HRH1P35367 487 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 RFX2P48378 723 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 TPPP2P59282 170 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 RND3P61587 244 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 TNXAQ16473 311 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 LCN12Q6JVE5 192 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM17Q86X19 198 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 LAX1Q8IWV1 398 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 Q8N402 240 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.79□□□□□ -1.48
RBBP4-211ENST00000477563 CLCC1Q96S66 551 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms