RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 OR2D2Q9H210 308 aa15.19■□□□□ 0.02
CAPN3-209ENST00000466222 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.19■□□□□ 0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.15■□□□□ 0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.15■□□□□ 0.02
CAPN3-209ENST00000466222 MED13LQ71F56 2210 aa15.15■□□□□ 0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
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CAPN3-209ENST00000466222 Q3ZCU0 254 aa15.13■□□□□ 0.01
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CAPN3-209ENST00000466222 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 EDARADDQ8WWZ3 215 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 RAB9BQ9NP90 201 aa15.13■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 NQO2P16083 231 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 OR4C12Q96R67 309 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 RBKSQ9H477 322 aa15.12■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF726P1Q15940 193 aa15.11■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.11■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 LYG1Q8N1E2 194 aa15.11■□□□□ 0.01
CAPN3-209ENST00000466222 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.11■□□□□ 0.01
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