RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 PLPPR2Q96GM1 343 aa15.2■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 METRNQ9UJH8 293 aa15.2■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SIAH2O43255 324 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MPDU1O75352 247 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 OR9G9P0C7N8 305 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35E4Q6ICL7 350 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MSL2Q9HCI7 577 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 GPX1P07203 203 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTDAPP60985 99 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 LTC4SQ16873 150 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 DCTN5Q9BTE1 182 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 HCFC1P51610 2035 aa15.19■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SNURFLB1AK76 121 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 LYZL6O75951 148 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRNB4P30926 498 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MIC13Q5XKP0 118 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TREML4Q6UXN2 200 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MGST2Q99735 147 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRBP23467 1997 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 DIRC3C9JPN6 131 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TCF21O43680 179 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CTRLP40313 264 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TGFBR3Q03167 851 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 RPEL1Q2QD12 228 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF2Q99496 336 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 GNB4Q9HAV0 340 aa15.18■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 AQP7O14520 342 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SP1P08047 785 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 COL8A2P25067 703 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MMDQ15546 238 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 GABRA6Q16445 453 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35E1Q96K37 410 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MXE2 369 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 J3QW42 95 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TCF15Q12870 199 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXF2Q12947 444 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MMD2Q8IY49 270 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.17■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 GCHFRP30047 84 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA45Q537H7 98 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ACP7Q6ZNF0 438 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 GNB1LQ9BYB4 327 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A5Q9H3V2 200 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PPIAL4AQ9Y536 164 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PROP1O75360 226 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV1-2P23083 117 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR31Q8NA23 367 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.16■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 C9JCJ5 164 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 NKX2-8O15522 239 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 FCGR3BO75015 233 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 RNFT1Q5M7Z0 435 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 C11orf52Q96A22 123 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 NRN1Q9NPD7 142 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 FZR1Q9UM11 496 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 V9GYV3 84 aa15.15■□□□□ 0.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR82Q6UXN9 313 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 STPG4Q8N801 248 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS46E5RG02 174 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV3-13P01766 116 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV3-7P01780 117 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 HTD2P86397 168 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 EDDM3AQ14507 147 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 MDS2Q8NDY4 140 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 Q8TCH9 128 aa15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.13■□□□□ 0.01
RALGPS1-208ENST00000424082 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms