RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.84□□□□□ -0.83
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GW64 132 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF320A2RRD8 509 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDCD5O14737 125 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHFRP00374 187 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV2-14P01704 120 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYGCP07315 174 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF735P0CB33 412 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AREGP15514 252 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DTYMKP23919 212 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAS1LP35410 378 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10A3P58181 314 aa9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0J9YWU9 116 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFITM5A6NNB3 132 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A5O76082 557 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DQB1P01920 261 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMB6P28072 239 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPCS2Q15005 226 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK9Q2XQG4 91 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM4SF20Q53R12 229 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGLLQ99685 303 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.82□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTXN2P0C2S0 81 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTRB1P17538 263 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF9Q07011 255 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL6IP1Q15041 203 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSX1Q16384 188 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYG2Q86SG7 212 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARC2Q969Z3 335 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA2Q9UM82 520 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.81□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REG1AP05451 166 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf88P0DMB2 117 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYL9P24844 172 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMI1P35226 326 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOC4P55056 127 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VBP1P61758 197 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf58Q96LI9 332 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.8□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRY2O43597 315 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC3BP05452 202 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFA4P12838 97 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOD1P15172 320 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB3BP20337 219 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR183P32249 361 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCS1P62166 190 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB135Q30KP9 77 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZWC4 215 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSX9Q7RTT3 188 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2C3Q8N628 320 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CGB1A6NKQ9 187 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCE2BO14633 110 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRASP01112 189 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-GP17693 338 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALP22466 123 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDNFQ49AH0 187 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF585BQ52M93 769 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HACD4Q5VWC8 232 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNIH2Q6PI25 160 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD4AQ8N468 514 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms