RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364234.1

RNU6-11P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 11, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-11P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-11P-201ENST00000364234 B4DEV8 164 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 C8orf87E5RJ46 101 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 H3BRN7 92 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 K7EQS6 105 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 PHYHO14832 338 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 IFNA14P01570 189 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 IGKV1D-12P01611 117 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 CRYGDP07320 174 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 CCL2P13500 99 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 NQO2P16083 231 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 RCVRNP35243 200 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 MAGEA6P43360 314 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 LPAR6P43657 344 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 AQP5P55064 265 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 RWDD2BP57060 319 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 HTR4Q13639 388 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 FLOT2Q14254 428 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 PDK2Q15119 407 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 SS18Q15532 418 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 FBXO48Q5FWF7 155 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 TSTD1Q8NFU3 115 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR5P2Q8WZ92 322 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 MND1Q9BWT6 205 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 POTEKPQ9BYX7 375 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 XKR8Q9H6D3 395 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 DMAC2Q9NW81 257 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 TAS2R13Q9NYV9 303 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 PSMD13Q9UNM6 376 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 SNX24Q9Y343 169 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 CEP162Q5TB80 1403 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 HSPG2P98160 4391 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 ROS1P08922 2347 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 RTL9Q8NET4 1388 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 USH2AO75445 5202 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 NCKAP5O14513 1909 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 MUC21A0A140T8X8 626 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 FNDC10F2Z333 226 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 C19orf84I3L1E1 186 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 UGT2B11O75310 529 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 SNAP29O95721 258 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 FADS2O95864 444 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 EPPINO95925 133 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 S100A9P06702 114 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 ARL14EPLP0DKL9 152 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 KCNJ3P48549 501 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 GABARAPL2P60520 117 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 UBE2KP61086 200 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 SLC35A2P78381 396 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 XIAPP98170 497 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 MAPK14Q16539 360 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM249Q2WGJ8 235 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 AHSA2Q719I0 299 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR5D18Q8NGL1 313 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR5K1Q8NHB7 308 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 DCANP1Q8TF63 244 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 CCDC127Q96BQ5 260 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 HBEGFQ99075 208 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZNF251Q9BRH9 671 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 UGT2B28Q9BY64 529 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 PRRG3Q9BZD7 231 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR51E2Q9H255 320 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 ASCL3Q9NQ33 180 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 FAM206AQ9NX38 181 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM216Q9P0N5 145 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR51B4Q9Y5P0 310 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 ALG5Q9Y673 324 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 ROBO3Q96MS0 1386 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 CLUHO75153 1309 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 FREM1Q5H8C1 2179 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 A0A1B0GX12 115 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 DHRS12A0PJE2 317 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 EFCAB9A8MZ26 197 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 GZMBP10144 247 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 GADD45AP24522 165 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 ATP6V0CP27449 155 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 GTF2BQ00403 316 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR4D1Q15615 310 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 EXOC3L4Q17RC7 722 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 EBLN2Q6P2I7 272 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 VN1R4Q7Z5H5 301 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR4P4Q8NGL7 312 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR11L1Q8NGX0 322 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR4X1Q8NH49 305 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR10A6Q8NH74 314 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 RORBQ92753 470 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 Q9BRP9 147 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 UPK3BQ9BT76 320 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-11P-201ENST00000364234 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms