RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TOPBP1Q92547 1522 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYH8P13535 1937 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAV5A0A0B4J249 113 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C9orf170A2RU37 121 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf74A8MZ97 194 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDCD6O75340 191 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DHRS3O75911 302 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CST1P01037 141 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RLN1P04808 185 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PORP16435 677 aaPredicted RBP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CRABP1P29762 137 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IFNAR2P48551 515 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CEBPGP53567 150 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIAA1024LP59773 190 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PJVKQ0ZLH3 352 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCGB2A2Q13296 93 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POU6F1Q14863 301 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NCF4Q15080 339 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 QPRTQ15274 297 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKDD1AQ495B1 522 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VPS26BQ4G0F5 336 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CARD16Q5EG05 197 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf82Q6UX34 121 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDUFA11Q86Y39 141 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PACRGLQ8N7B6 248 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR4B1Q8NGF8 309 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNS1Q96KK3 526 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINI1Q99574 410 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EURLQ9NYK6 297 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLEC4AQ9UMR7 237 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DIP2BQ9P265 1576 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCC6O95255 1503 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUP160Q12769 1436 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBAKDNA6NC62 111 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 URADA6NGE7 173 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SGK494L7N484 410 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TOR1AO14656 332 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BCE1O60756 84 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B3GALNT1O75752 331 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TDP2O95551 362 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ASS1P00966 412 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPIND1P05546 499 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FERP16591 822 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAC1P20366 129 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC2A5P22732 501 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HTR2AP28223 471 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SSR4P51571 173 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACTBP60709 375 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB4BP61018 213 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC40Q4G0X9 1142 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM220Q6QAJ8 160 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM159AQ6UWV7 190 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q6ZQY7 126 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DRAM1Q8N682 238 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM216BQ8N7L0 139 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR4M2Q8NGB6 313 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM57AQ8TBR7 257 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DTNBP1Q96EV8 351 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 YPEL4Q96NS1 127 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RARRES2Q99969 163 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAGEF1Q9HAY2 307 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CEP164Q9UPV0 1460 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCN11AQ9UI33 1791 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIF15Q9NS87 1388 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM72A0PK05 275 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB19A4D1S5 217 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR11H12B2RN74 326 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTP4A3O75365 173 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IDH1O75874 414 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LYZL6O75951 148 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBP1P09467 338 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM58BPP0C7Q3 252 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EVI2AP22794 236 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RABIFP47224 123 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCL11P51671 97 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BLVRAP53004 296 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPX6P59796 221 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB2AP61019 212 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARF1P84077 181 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms