RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 PIGPP57054 158 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 PROK1P58294 105 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 KRTAP10-3P60369 221 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 HERV-K104P61576 105 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 SRPXP78539 464 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 BVESQ8NE79 360 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 SLC35D1Q9NTN3 355 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 RNF114Q9Y508 228 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 TNFSF12O43508 249 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 LINC01548A6NM66 108 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 M0QZK8 103 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 MMDQ15546 238 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 MSMO1Q15800 293 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 C12orf54Q6X4T0 127 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 PDPNQ86YL7 162 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 NPBQ8NG41 125 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 OR10C1Q96KK4 312 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 ANK2Q01484 3957 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 APOA2P02652 100 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 M6PRP20645 277 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 SMCO1Q147U7 214 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 LGI3Q8N145 548 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 OR2T6Q8NHC8 308 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-201ENST00000328024 H0YIZ8 118 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 HAX1O00165 279 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 NBR2O15453 112 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 NDUFA3O95167 84 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 HOXB5P09067 269 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RND3P61587 244 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM187Q14656 261 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 C9orf152Q5JTZ5 239 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 OR1S1Q8NH92 325 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA3Q8NHX4 192 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 ADTRPQ96IZ2 230 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 SLC2A9Q9NRM0 540 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1B0GUS0 222 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZP3P21754 424 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 BAP18Q8IXM2 172 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 NUDT19A8MXV4 375 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 IGLV2-23P01705 113 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 FGF2P09038 288 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RPS16P62249 146 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RAB32Q13637 225 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM177Q53S58 311 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF66Q6ZN08 573 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 WFDC12Q8WWY7 111 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RNF5Q99942 180 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 HSPB9Q9BQS6 159 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 FBXL15Q9H469 300 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHA2Q9HB19 425 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 TMED3Q9Y3Q3 217 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 FCGR3BO75015 233 aa15.93■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 PSG5Q15238 335 aa15.93■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 C5orf64Q2M2E5 130 aa15.93■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.93■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.93■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RASL11BQ9BPW5 248 aa15.93■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 WNT10AQ9GZT5 417 aa15.93■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RRHO14718 337 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 CRYZL1O95825 349 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 IGHG2P01859 326 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF747Q9BV97 191 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 TPSG1Q9NRR2 321 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 GSKIPQ9P0R6 139 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 FCN1O00602 326 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RTL8BQ17RB0 113 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 C3orf56Q8N813 242 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 CXorf58Q96LI9 332 aa15.92■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 MPTX1A8MV57 137 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 GPR31O00270 319 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RAMP3O60896 148 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 DEDDO75618 318 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 OR5AC1P0C628 307 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 RNF141Q8WVD5 230 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 HARBI1Q96MB7 349 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 CYTL1Q9NRR1 136 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.91■□□□□ 0.14
RAB11B-201ENST00000328024 LINC00527Q9UJ94 153 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms