RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 SIRPDQ9H106 197 aa8.49□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.49□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 PRH1P02810 166 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 MYOD1P15172 320 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 LGALS7P47929 136 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 BLOC1S1P78537 153 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 ATP6V1FQ16864 119 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 PERPQ96FX8 193 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 PARP11Q9NR21 331 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 DPM3Q9P2X0 92 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 TACC2O95359 2948 aa8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 UMAD1C9J7I0 102 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 TRIM77I1YAP6 450 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 SLC25A17O43808 307 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 CAMLGP49069 296 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 F2RL1P55085 397 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 NRGNQ92686 78 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 MMP26Q9NRE1 261 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 VWC2LB2RUY7 222 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 TOX4O94842 621 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 OPN1MWP04001 364 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 NPY1RP25929 384 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 ZNF616Q08AN1 781 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 VWC2Q2TAL6 325 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 RSG1Q9BU20 258 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 HRH4Q9H3N8 390 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 RFNGQ9Y644 331 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.47□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 NUDT19A8MXV4 375 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 FAM157AC9JC47 383 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 RRHO14718 337 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 TIMM23O14925 209 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 FHITP49789 147 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 RAB11AP62491 216 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 MARC2Q969Z3 335 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.46□□□□□ -1.05
COPS2-201ENST00000299259 MED13LQ71F56 2210 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 A0A1W2PRD5 423 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 A0A1W2PRF3 423 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 A0A1W2PRM7 423 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 RAB19A4D1S5 217 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 IFNA4P05014 189 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 PAX1P15863 534 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 FGF7P21781 194 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 TEX45Q8NA69 505 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 RITA1Q96K30 269 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 TBX15Q96SF7 602 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.46□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 PLXNB1O43157 2135 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 PRSS46E5RG02 174 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 VENTXO95231 258 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 CA2P00918 260 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 ZP3P21754 424 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 LGALS4P56470 323 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 ZNF787Q6DD87 383 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 BTNL8Q6UX41 500 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 CFHR4Q92496 578 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 GGACTQ9BVM4 153 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.45□□□□□ -1.06
COPS2-201ENST00000299259 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms