RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 CryzP47199 331 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ube2nP61089 152 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20909Q5FWB5 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20852Q5M8R5 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Npy4rQ61041 375 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 SspnQ62147 216 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20917Q62457 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20809Q62458 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20865Q62460 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20738Q810R8 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr830Q8VFJ5 315 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem19Q91W52 336 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20806Q9D9T3 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 SiglechB7ZMQ6 332 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 IfngP01580 155 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hsf1P38532 525 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc25a4P48962 298 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Chrna7P49582 502 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r181Q0P547 304 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp975Q6NVD6 525 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1386Q7TQT0 309 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Acsm5Q8BGA8 578 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ino80cQ8BHA0 191 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 A930004D18RikQ8C8W7 157 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lyrm2Q8R033 88 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rab5aQ9CQD1 215 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccr9Q9WUT7 369 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp456B2RUK9 458 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr204E9Q8M0 305 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnase2bO35292 155 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr27O54897 379 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fkbp2P45878 140 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 F13bQ07968 669 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ctsll3Q3ULP7 331 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc7a15Q50E62 488 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 PnkdQ69ZP3 385 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vstm2lQ6PDS0 220 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr138Q7TRI7 312 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pgam5Q8BX10 288 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pomt1Q8R2R1 746 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr136Q8VG72 312 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dmrtc1c1Q9D410 238 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Klk1b27Q9JM71 263 aa9.89□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Esp8F7AMQ8 149 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 9130204L05RikG3UWB8 92 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm10881P01642 115 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Igsf11P0C673 428 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hist1h1aP43275 213 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Thbs3Q05895 956 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2-M10.3Q85ZW6 330 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wbp1lQ8BGW2 348 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 BmperQ8CJ69 685 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc6a8Q8VBW1 640 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eva1aQ91WM6 156 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ear10Q923L6 156 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Glrx2Q923X4 156 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wbp2nlQ9D529 359 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fgf16Q9ESL8 207 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr122W4VSP0 330 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 6330409D20RikA2AK85 162 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 4930444P10RikD3YUR1 185 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 StomP54116 284 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ube2g2P60605 165 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ceacam10Q61400 265 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 RflnaQ7TS73 204 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Prrg4Q8BGN6 226 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Adamts4Q8BNJ2 833 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Parp11Q8CFF0 331 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Osbpl11Q8CI95 751 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r193Q8R258 319 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dazap2Q9DCP9 168 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sdf2l1Q9ESP1 221 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr34Q9R1K6 375 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 TpbgQ9Z0L0 426 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm37240E9QAY5 252 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hbb-yP02104 147 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cks2P56390 79 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dnase2P56542 353 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dhrs2Q149L0 282 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Samt2Q497M0 247 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cyb561Q60720 250 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ntf4Q80VU4 209 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cstl1Q80Y72 140 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r178Q8R2B6 304 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1233Q8VGN0 305 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrpl3Q99N95 348 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rps21Q9CQR2 83 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eaf1Q9D4C5 268 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vstm2bQ9JME9 285 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rspo1Q9Z132 265 aa9.88□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 CrygsO35486 178 aa9.87□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Evx1P23683 416 aa9.87□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 P2ry1P49650 373 aa9.87□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr504Q7TRU7 318 aa9.87□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Crispld2Q8BZQ2 495 aa9.87□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 SowahbQ8BZW2 760 aa9.87□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Plekha2Q9ERS5 425 aa9.87□□□□□ -0.83
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbp1Q9QXD6 338 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.1 ms