RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637083.1

CLN8-212, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-212ENST00000637083 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 RTL8BQ17RB0 113 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 RAB24Q969Q5 203 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 RHOVQ96L33 236 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 PRNDQ9UKY0 176 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 A0A1W2PPV4 95 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 DPRXA6NFQ7 191 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 GFRA3O60609 400 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SELLP14151 372 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 RAB31Q13636 194 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 ELOBQ15370 118 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 ADIPOQQ15848 244 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.99□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 PPIAL4DF5H284 164 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TMPRSS2O15393 492 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 KBTBD11O94819 623 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 IGHV3-7P01780 117 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 NDUFB7P17568 137 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TLE1Q04724 770 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 BSPH1Q075Z2 132 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 OR4A47Q6IF82 309 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SAP30LQ9HAJ7 183 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.98□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 ZNF98A6NK75 572 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 FNDC10F2Z333 226 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 AP4M1O00189 453 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 OPN1MWP04001 364 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 RND2P52198 227 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 CD81P60033 236 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 CCL8P80075 99 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 FOXC1Q12948 553 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 HNF4GQ14541 408 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TBR1Q16650 682 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 A0A1W2PPE3 182 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 NPY1RP25929 384 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TREML4Q6UXN2 200 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TCF23Q7RTU1 214 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 ZNF383Q8NA42 475 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 Q8NA96 180 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 NANPQ8TBE9 248 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 Q8WTZ3 238 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 RND1Q92730 232 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 LEAP2Q969E1 77 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 C12orf57Q99622 126 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 K7ENP7 123 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 PDE6DO43924 150 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 APOA2P02652 100 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 GNG10P50151 68 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 MEOX2P50222 304 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 OR4F5Q8NH21 305 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 ZNF714Q96N38 554 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 OR4F4Q96R69 305 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 MS4A5Q9H3V2 200 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-212ENST00000637083 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 PRSS46E5RG02 174 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 RRHO14718 337 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 NDUFB3O43676 98 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 VENTXO95231 258 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 IGHV2-5P01817 119 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 THBDP07204 575 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 TEPPQ6URK8 271 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-212ENST00000637083 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms