RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	LHB	P01229	141 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GYPA	P02724	150 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CFHR2	P36980	270 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HINT2	Q9BX68	163 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	NAT8	Q9UHE5	227 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RELN	P78509	3460 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	F2RL2	O00254	374 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	MYOD1	P15172	320 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	COL8A2	P25067	703 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SPCS3	P61009	180 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CCL8	P80075	99 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152		Q8N7P7	452 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TNC	P24821	2201 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SELENOV	P59797	346 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RELB	Q01201	579 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	FRZB	Q92765	325 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	IFITM10	A6NMD0	228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	MMP23A	O75900	390 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	KBTBD11	O94819	623 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	OPN1MW	P04001	364 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFB7	P17568	137 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	HOXA5	P20719	270 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	BSX	Q3C1V8	233 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CST9LP1	Q5W188	147 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPV4	95 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SOX15	O60248	233 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GFRA3	O60609	400 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TRGC1	P0CF51	173 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CD40	P25942	277 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CR1L	Q2VPA4	569 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	MIC13	Q5XKP0	118 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TCF19	Q9Y242	345 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152		A8MXE2	369 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TIMP3	P35625	211 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	RND2	P52198	227 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM250	H0YL14	139 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS2	O15393	492 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CGB3	P0DN86	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CGB7	P0DN87	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5G3	P48201	142 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BRF1-222	ENST00000635152	NPPC	P23582	126 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	TCF23	Q7RTU1	214 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	DDB2	Q92466	427 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BRF1-222	ENST00000635152	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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