RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNG5Q9UF02 275 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.642e-7■■□□□ 13.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf51A6NDU8 294 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 A6NDX4 124 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MARCH11A6NNE9 402 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OOSP1A8MZH6 123 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 E7EUB6 86 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAF2O60831 178 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CDS2O95674 445 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SCGB1D2O95969 90 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HPRT1P00492 218 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MOSP00540 346 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYGBP07316 175 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 P0C879 139 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SRD5A1P18405 259 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HNF1AP20823 631 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CD1BP29016 333 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 KIR2DS2P43631 304 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 IER3P46695 156 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RAG2P55895 527 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 H2BFSP57053 126 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 NDPQ00604 133 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CD83Q01151 205 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFA5Q01523 94 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM177Q53S58 311 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 Q5BKY6 102 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6YL49 198 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PDPNQ86YL7 162 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N9W7 124 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T10Q8NGZ9 312 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 COQ8AQ8NI60 647 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOVQ96L33 236 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM56Q96MV1 263 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HINT2Q9BX68 163 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGT1Q9H0U3 335 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MED28Q9H204 178 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 GSKIPQ9P0R6 139 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TCF19Q9Y242 345 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SIGLEC9Q9Y336 463 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ITPR3Q14573 2671 aa4.79□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GW64 132 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HMX3A6NHT5 357 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CGB1A6NKQ9 187 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 UPK2O00526 184 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RRHO14718 337 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 NBR2O15453 112 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ST8SIA3O43173 380 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNL1O43396 289 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNAB3O43448 404 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CA2P00918 260 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 AMY1AP04745 511 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 REG1AP05451 166 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SULT1A3P0DMM9 295 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SULT1A4P0DMN0 295 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ANXA3P12429 323 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 NQO2P16083 231 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 BRS3P32247 399 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MC5RP33032 325 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 BCAP31P51572 246 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 BLCAPP62952 87 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 EBI3Q14213 229 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PLGLAQ15195 96 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TNXAQ16473 311 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 NMSQ5H8A3 153 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf88Q6PI97 169 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CITED4Q96RK1 184 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PHB2Q99623 299 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
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