RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC22A5O76082 557 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TPPPO94811 219 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KBTBD11O94819 623 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR2C1O95371 312 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHV3-23P01764 117 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF735P0CB33 412 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FOLR2P14207 255 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CNIH2Q6PI25 160 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CCDC140Q96MF4 163 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR2A7Q96R45 310 aa8.34□□□□□ -1.07
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.34□□□□□ -1.07
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPATA2Q9UM82 520 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 S4R3C0 116 aa8.34□□□□□ -1.07
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR11H12B2RN74 326 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NDUFB8O95169 186 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CRYGCP07315 174 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MYOD1P15172 320 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 AREGP15514 252 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KLK9Q2XQG4 91 aa8.33□□□□□ -1.08
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.33□□□□□ -1.08
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.32□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.32□□□□□ -1.08
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SSX9Q7RTT3 188 aa8.32□□□□□ -1.08
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 REG1AP05451 166 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PTHLHP12272 177 aa8.31□□□□□ -1.08
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TPRA1Q86W33 373 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPARTQ8N0X7 666 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IL17DQ8TAD2 202 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MLXQ9UH92 298 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RAB26Q9ULW5 256 aa8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 JTBO76095 146 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HRASP01112 189 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HLA-GP17693 338 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PSMB9P28065 219 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MSMO1Q15800 293 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR4A47Q6IF82 309 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF773Q6PK81 442 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BEST4Q8NFU0 473 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.3□□□□□ -1.08
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.3□□□□□ -1.08
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