RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARCH11A6NNE9 402 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GALNT1O75752 331 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-16P61578 105 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf99Q6UWK7 81 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 DMBX1Q8NFW5 382 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGMS2Q8NHU3 365 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TP53RKQ96S44 253 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTL6BO94805 426 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINE2P07093 398 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4A5Q8NH83 315 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD28P10747 220 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPA2P15927 270 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFHR3Q02985 330 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 COMMD1Q8N668 190 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 WSB1Q9Y6I7 421 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV41A0A0B4J266 112 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRASP01116 189 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNXAQ16473 311 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRPEL2Q8TAA5 225 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAA60Q9H7X0 242 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM140Q9NV12 185 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa26■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNHD1Q96M86 4753 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 G3V318 75 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ECSCRQ19T08 205 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX38Q6PEX7 206 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CADM3Q8N126 398 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 G6PCP35575 357 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCR6P51684 374 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKIRIN2Q53H80 203 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLA2G10O15496 165 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1-39P01597 117 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1D-39P04432 117 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 UCP1P25874 307 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIFP30405 207 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAS1LP35410 378 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL8P62917 257 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD83Q01151 205 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf54Q5BKX5 351 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGPP2Q8IWX5 399 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 LFNGQ8NES3 379 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM230Q96A57 120 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHG4P01861 327 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF2P09038 288 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5AC1P0C628 307 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SP6Q3SY56 376 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MINDY2Q8NBR6 621 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTCP35070 178 aa25.96■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC22AQ96IW7 307 aa25.96■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM222Q9H0R3 208 aa25.96■■□□□ 1.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 UPK2O00526 184 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYRM1O43325 122 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR1C4P17516 323 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM16LQ309B1 348 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMED4Q7Z7H5 227 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNT14Q96FL9 552 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFB6O95139 128 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXE3Q13461 319 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLYATL2Q8WU03 294 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM68Q96MH6 324 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 UPK1BO75841 260 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPN1MWP04001 364 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELANEP08246 267 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPN1MW2P0DN77 364 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPN1MW3P0DN78 364 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-GP17693 338 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHODHQ02127 395 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHB2Q99623 299 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV3A0A0B4J244 114 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PN81 502 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSGN1A6NI15 193 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG12O94817 140 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDS2O95674 445 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNA7P36544 502 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM128Q5BJH2 165 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf55Q5SWW7 151 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPIN2AQ99865 258 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV1-40P01703 118 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMB8P28062 276 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA11Q86Y39 141 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms