RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 M0QZK8 103 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 CRYABP02511 175 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 GYPAP02724 150 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 GABRA2P47869 451 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 VWC2Q2TAL6 325 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR8G2PQ6IF36 304 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACSM6Q6P461 480 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRGPRDQ8TDS7 321 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1W2PPQ1 181 aa16.89■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC30A6NM36 301 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 AQP7O14520 342 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 S1PR2O95136 353 aa16.89■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 KITLGP21583 273 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 ELLP55199 621 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 C17orf98A8MV24 154 aa16.88■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 DIRC2Q96SL1 478 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 FZR1Q9UM11 496 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFNL4K9M1U5 179 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOX15O60248 233 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 TDGF1P3P51864 188 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 TEX38Q6PEX7 206 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLN8Q9UBY8 286 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 METRNQ9UJH8 293 aa16.87■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PMS2P5A8MQ11 134 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR10J1P30954 320 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 FABP6P51161 128 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 GNB2P62879 340 aa16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 RELQ04864 619 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMIM21Q3B7S5 101 aa16.86■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PXMP4Q9Y6I8 212 aa16.86■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF718Q3SXZ3 478 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR13A1Q8NGR1 328 aa16.85■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PRR14LQ5THK1 2151 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 DOCK11Q5JSL3 2073 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL3RAP26951 378 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOXF2Q12947 444 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 GAGE1Q13065 139 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 TPRX1Q8N7U7 411 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR10G9Q8NGN4 311 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR10G7Q8NGN6 311 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR4F5Q8NH21 305 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 SARAFQ96BY9 339 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR4F4Q96R69 305 aa16.85■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE6DO43924 150 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGLV1-44P01699 117 aa16.84■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.84■□□□□ 0.29
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CCNDBP1-205ENST00000564630 IGHV3-43DP0DP04 118 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 LINC01551Q86U37 167 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB1CQ92928 201 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 TXNDC17Q9BRA2 123 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC25A22Q9H936 323 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa16.84■□□□□ 0.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 LINC00473A8K010 186 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa16.82■□□□□ 0.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa16.82■□□□□ 0.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa16.82■□□□□ 0.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 SELENOTP62341 195 aa16.82■□□□□ 0.28
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