RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087X0M5 115 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GX30 115 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 MPPED1O15442 326 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HSPA12AO43301 675 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV2-14P01704 120 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 AMY1AP04745 511 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CXCL3P19876 107 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CD34P28906 385 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 SSTR5P35346 364 aa7.27□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 HES1Q14469 280 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 MORN2Q502X0 79 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 COQ8AQ8NI60 647 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IL22RA2Q969J5 263 aa7.27□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 AGMATQ9BSE5 352 aa7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.27□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.26□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 C1QBP02746 253 aa7.26□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 CD300CQ08708 224 aa7.26□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 LIN54Q6MZP7 749 aa7.26□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.26□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF429Q86V71 674 aa7.26□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.26□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.26□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 ATP6V1G1O75348 118 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 SAP30O75446 220 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CDS2O95674 445 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 F2RP25116 425 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 UCP1P25874 307 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 H2BFSP57053 126 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 LGI3Q8N145 548 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 SORL1Q92673 2214 aa7.25□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 AP4M1O00189 453 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 RGS13O14921 159 aa7.24□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 OR5AC1P0C628 307 aa7.24□□□□□ -1.25
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SMAD3-215ENST00000560424 OR8U9P0C7N5 309 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 RPA2P15927 270 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM11P17152 192 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 C4BPBP20851 252 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 PRRX1P54821 245 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 GNMTQ14749 295 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.24□□□□□ -1.25
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