RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	RAB9B	Q9NP90	201 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	LYRM9	A8MSI8	78 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617		M0R1X1	148 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ARPC2	O15144	300 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKV3-20	P01619	116 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25	4e-14	■□□□□ 11
ABCD4-222	ENST00000555617	CXCR4	P61073	352 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	RRN3P1	Q2M238	152 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CPO	Q8IVL8	374 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	STX19	Q8N4C7	294 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OR52N1	Q8NH53	320 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CBY3	A6NI87	242 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PSCA	O43653	123 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	GAST	P01350	101 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PSMG4	Q5JS54	123 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PELI1	Q96FA3	418 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	DPPA5	A6NC42	116 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FCER2	P06734	321 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF735	P0CB33	412 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OCM2	P0CE71	109 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	M6PR	P20645	277 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	HMGN3	Q15651	99 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	LGALS12	Q96DT0	336 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	NSL1	Q96IY1	281 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	EBAG9	O00559	213 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	LECT2	O14960	151 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	RSU1	Q15404	277 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	GALM	Q96C23	342 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ADI1	Q9BV57	179 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A0G2JND7	137 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	UBE2QL1	A1L167	161 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SC5D	O75845	299 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CTSG	P08311	255 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	AZU1	P20160	251 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	MRGBP	Q9NV56	204 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	YIF1A	O95070	293 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	SERPINA2	P20848	420 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	RRM2	P31350	389 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	IFNGR2	P38484	337 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	GYS2	P54840	703 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	ASAH1	Q13510	395 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	CDK10	Q15131	360 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	MPV17L	Q2QL34	196 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	GGH	Q92820	318 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	GPX5	O75715	221 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	ACTL6B	O94805	426 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	CRYZL1	O95825	349 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ABCD4-222	ENST00000555617	DEFA4	P12838	97 aa		7.2	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms