RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PPE3 182 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 THBDP07204 575 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 GCHFRP30047 84 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 CKS2P33552 79 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf52A6NGY3 159 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 CD59P13987 128 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 TRGV3P03979 118 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF137PP52743 207 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 PRSS12P56730 875 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01560Q8TB33 94 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GTI1 187 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 ATP5LO75964 103 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 CSN3P07498 182 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 C18orf12Q96KH6 178 aa7.17□□□□□ -1.26
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