RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-222ENST00000540445 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-222ENST00000540445 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-222ENST00000540445 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-222ENST00000540445 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-222ENST00000540445 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-222ENST00000540445 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-222ENST00000540445 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-222ENST00000540445 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RYR2Q92736 4967 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FAM223BA6NKX1 122 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 H0Y980 276 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SULT1C2O00338 296 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 OR2J3O76001 311 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 IGLV1-51P01701 117 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 DEFA4P12838 97 aa6.89□□□□□ -1.31
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LMO3-222ENST00000540445 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RFX2P48378 723 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 HERV-K104P61576 105 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CATR1Q13166 79 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 C15orf32Q32M92 178 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TMEM17Q86X19 198 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 NECAP1Q8NC96 275 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.89□□□□□ -1.31
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LMO3-222ENST00000540445 ZMAT4Q9H898 229 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 EHFQ9NZC4 300 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 PEMTQ9UBM1 199 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 E7EUB6 86 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 DHFRP00374 187 aa6.88□□□□□ -1.31
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LMO3-222ENST00000540445 PMP2P02689 132 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CSN3P07498 182 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 PRSS3P35030 304 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ZNF45Q02386 682 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 MSMO1Q15800 293 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 OR4A47Q6IF82 309 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 OR51H1Q8NH63 302 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 BORCS5Q969J3 196 aa6.88□□□□□ -1.31
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LMO3-222ENST00000540445 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TEX22C9J3V5 150 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 PPP5D1E7EU14 171 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-23P01764 117 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 REG1AP05451 166 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ZNF735P0CB33 412 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RPA2P15927 270 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 NQO2P16083 231 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 HLA-GP17693 338 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 PSMB6P28072 239 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R31P59538 309 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R20P59543 309 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TSPAN5P62079 268 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FAM209BQ5JX69 171 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 LCN12Q6JVE5 192 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.87□□□□□ -1.31
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LMO3-222ENST00000540445 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 OR4A5Q8NH83 315 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RCHY1Q96PM5 261 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TUBA4BQ9H853 241 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 BET1LQ9NYM9 111 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 S4R3C0 116 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ZNF320A2RRD8 509 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 BMPR1BO00238 502 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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