RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PRR22Q8IZ63 422 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FADS6Q8N9I5 356 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR5R1Q8NH85 324 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 MUCL1Q96DR8 90 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TVP23CQ96ET8 276 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 BANF2Q9H503 90 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CALHM2Q9HA72 323 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RAB9BQ9NP90 201 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 DKKL1Q9UK85 242 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 DOCK7Q96N67 2140 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 LINC00587B1AMM8 73 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 H3BSH0 61 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PPP1R2P9O14990 202 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 XRCC2O43543 280 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PDCD6O75340 191 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 IFNA1P01562 189 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OPN1MWP04001 364 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 P04436 131 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CSN3P07498 182 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CST2P09228 141 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 VDAC1P21796 283 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 GLIPR1P48060 266 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RND2P52198 227 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TAS2R30P59541 319 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SERF2P84101 59 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TAF9Q16594 264 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 MPV17LQ2QL34 196 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR2A2Q6IF42 318 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR2M3Q8NG83 312 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RAB40CQ96S21 281 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PFDN5Q99471 154 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 GGACTQ9BVM4 153 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 Q9N2K0 584 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PLCE1Q9P212 2302 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 A0A1B0GU03 582 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 A0A1W2PP11 408 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR6C6A6NF89 314 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TRDCB7Z8K6 153 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 C9JQL5 133 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TSTD3H0UI37 97 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMEM178BH3BS89 294 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CLDN34H7C241 214 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 M0R135 149 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PROP1O75360 226 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CLN5O75503 358 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CCL3P10147 92 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SERPINA2P20848 420 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FUT3P21217 361 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CEACAM6P40199 344 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CD200P41217 278 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HILS1P60008 231 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PKIAP61925 76 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 UBE2V2Q15819 145 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 STX12Q86Y82 276 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OSR2Q8N2R0 312 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.54□□□□□ -1.36
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