RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 NABP2Q9BQ15 211 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 GINS3Q9BRX5 216 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 BET1LQ9NYM9 111 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 PSENENQ9NZ42 101 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 FBXL17Q9UF56 701 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 PRNDQ9UKY0 176 aa6.11□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.11□□□□□ -1.43
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SEC31A-241ENST00000515749 IGHV4-39P01824 125 aa6.1□□□□□ -1.43
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SEC31A-241ENST00000515749 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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SEC31A-241ENST00000515749 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 ENY2Q9NPA8 101 aa6.09□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 DPM3Q9P2X0 92 aa6.09□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.09□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 NUP50Q9UKX7 468 aa6.09□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.09□□□□□ -1.43
SEC31A-241ENST00000515749 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SEC31A-241ENST00000515749 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.08□□□□□ -1.44
SEC31A-241ENST00000515749 AKAP6Q13023 2319 aa6.08□□□□□ -1.44
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