RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	CASP6	P55212	293 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZXDA	P98168	799 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SRY	Q05066	204 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		Q0VG73	95 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXF2	Q12947	444 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PSG7	Q13046	419 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CATR1	Q13166	79 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SSPN	Q14714	243 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR1C1	Q15619	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZR03	302 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GALM	Q96C23	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MGST2	Q99735	147 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	WNT9B	O14905	357 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PROP1	O75360	226 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SERF1A	O75920	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFSF15	O95150	251 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CXorf1	O96002	111 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CELA3B	P08861	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	IRF2	P14316	349 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SELE	P16581	610 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KITLG	P21583	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CBLN1	P23435	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	G0S2	P27469	103 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GCHFR	P30047	84 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CDKN1A	P38936	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MPV17	P39210	176 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGEA5	P43359	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	EDDM3B	P56851	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00205	P59089	165 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TPPP2	P59282	170 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2G2	P60604	165 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HTD2	P86397	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C3AR1	Q16581	482 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MLANA	Q16655	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		R4GN57	208 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		V9GYV3	84 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	VCAN	P13611	3396 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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