RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q6ZRM9 215 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TEX29Q8N6K0 151 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TEX45Q8NA69 505 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR5B3Q8NH48 314 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBKSQ9H477 322 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MMP26Q9NRE1 261 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 U3KQ87 197 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AKAP6Q13023 2319 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHD6Q8TD26 2715 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1W2PN81 502 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C15orf61A6NNL5 157 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LY6LH3BQJ8 138 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RGS13O14921 159 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSPAN9O75954 239 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MOSP00540 346 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IFNA5P01569 189 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV1-16P04430 117 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHRNA7P36544 502 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SULT1A1P50225 295 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BPIFB3P59826 476 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HES1Q14469 280 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MMD2Q8IY49 270 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1RLQ9NZP8 487 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NPFFO15130 113 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IFNA10P01566 189 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR9G9P0C7N8 305 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IAPPP10997 89 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR2B8PP59922 312 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RELBQ01201 579 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KLRD1Q13241 179 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SSX2Q16385 188 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP6V1FQ16864 119 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AARDQ4LEZ3 155 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf159Q96HA4 380 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBX15Q96SF7 602 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HINT2Q9BX68 163 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 REG4Q9BYZ8 158 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1W2PRD5 423 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1W2PRF3 423 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1W2PRM7 423 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TIMM23O14925 209 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR8U8P0C7N1 319 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNCAP37840 140 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP10-9P60411 292 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BAP18Q8IXM2 172 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LILRB2Q8N423 598 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STOML3Q8TAV4 291 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ST8SIA2Q92186 375 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FBXL17Q9UF56 701 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1W2PPI3 338 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC25A17O43808 307 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV1-69P01742 117 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HTR2BP41595 481 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DLX1P56177 255 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HCP5Q6MZN7 132 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TCF19Q9Y242 345 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MSGN1A6NI15 193 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms