RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TAS2R31	P59538	309 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	MEF2D	Q14814	521 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF79	Q15937	498 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	POC5	Q8NA72	575 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1W2PN81	502 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	KBTBD11	O94819	623 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHRNA7	P36544	502 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB9A	P51151	201 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNB1	P62873	340 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF585B	Q52M93	769 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	CADM3	Q8N126	398 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	COL7A1	Q02388	2944 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	S1PR2	O95136	353 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	BRI3	O95415	125 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PF4V1	P10720	104 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	NQO2	P16083	231 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	RND3	P61587	244 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNXA	Q16473	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	S100G	P29377	79 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAS1L	P35410	378 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	P2RX4	Q99571	388 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	DISC1	C4P0D8	188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131		H3BUA1	57 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	MPPED1	O15442	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	FGF2	P09038	288 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	MYCNOS	P40205	109 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	LPAR6	P43657	344 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	RUNX1	Q01196	453 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131		E7EUB6	86 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131		I3L521	148 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	UPK2	O00526	184 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ACTL6B	O94805	426 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PI3	P19957	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPP5C	P53041	499 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PIGP	P57054	158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PYDC2	Q56P42	97 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q8N402	240 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRRT1	Q99946	306 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRR	Q9GZT4	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM140	Q9NV12	185 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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