RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP2-218ENST00000511185 M0QYG6 137 aa14.4□□□□□ -0.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR2A4O95047 310 aa14.4□□□□□ -0.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.38□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 31.2
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SH3BP2-218ENST00000511185 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP2-218ENST00000511185 CD40LGP29965 261 aa14.38□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.38□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD1Q96SE0 405 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP2-218ENST00000511185 SORL1Q92673 2214 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BMQ9 156 aa14.37□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 HRASP01112 189 aa14.37□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 AREGP15514 252 aa14.37□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 DGCR2P98153 550 aa14.37□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM140Q9NV12 185 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP2-218ENST00000511185 BET1LQ9NYM9 111 aa14.37□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 RGS5O15539 181 aa14.36□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF735P0CB33 412 aa14.36□□□□□ -0.11
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SH3BP2-218ENST00000511185 MAS1LP35410 378 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP5CP53041 499 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2B8PP59922 312 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4A5Q8NH83 315 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 BORCS5Q969J3 196 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
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