RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 NTF3P20783 257 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 LIME1Q9H400 295 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 MED29Q9NX70 200 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 FRG2CA6NGY1 282 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 REG1AP05451 166 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 H3BRM9 83 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 MS4A18Q3C1V0 323 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 F5H5K5 113 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 Q96M66 194 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF737O75373 536 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 CLPSP04118 112 aa9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 CHST1O43916 411 aa9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 SEC11AP67812 179 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 LRP5LA4QPB2 252 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.91□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 ID3Q02535 119 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 TESK1Q15569 626 aa9.91□□□□□ -0.82
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SH3BP2-217ENST00000510204 RAB37Q96AX2 223 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 IL36GQ9NZH8 169 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 hDV102S1A0JD36 115 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM250H0YL14 139 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 DEGS1O15121 323 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-217ENST00000510204 IGFBP4P22692 258 aa9.91□□□□□ -0.82
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