RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496536.1

GMPPA-212, Transcript of GDP-mannose pyrophosphorylase A, humanhuman

TSL 5

Gene GMPPA, Length 302 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMPPA-212ENST00000496536 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.7□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.7□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 RSG1Q9BU20 258 aa8.7□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 GGACTQ9BVM4 153 aa8.7□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 CALYQ9NYX4 217 aa8.7□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.025e-9■■■□□ 15.6
GMPPA-212ENST00000496536 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 A0A1B0GV50 99 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 A6NNC1 897 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 MARCH11A6NNE9 402 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 LINC00473A8K010 186 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 VSTM5A8MXK1 200 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 C16orf97H3BN30 126 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 M0R1X1 148 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 MPDU1O75352 247 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 CRLF1O75462 422 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 CD55P08174 381 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 IRF2P14316 349 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 NQO2P16083 231 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 RAB5AP20339 215 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 THBS3P49746 956 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 STUMQ69YW2 141 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 C1QL4Q86Z23 238 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ZNF709Q8N972 641 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 S1PR3Q99500 378 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 GNG13Q9P2W3 67 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 CLN8Q9UBY8 286 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 PROP1O75360 226 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 OR2C1O95371 312 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 IGHV1-46P01743 117 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 TFF1P04155 84 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 FAM27E3Q08E93 113 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ZNF726P1Q15940 193 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 OR4A16Q8NH70 328 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 OR4S2Q8NH73 311 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 RAB39BQ96DA2 213 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 YPEL4Q96NS1 127 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 GCM1Q9NP62 436 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.68□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 CYB5BO43169 146 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 TGOLN2O43493 480 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 FCGR3BO75015 233 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ABCA1O95477 2261 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 IFNA17P01571 189 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ARG1P05089 322 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 TNFRSF1AP19438 455 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 FGF7P21781 194 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 AKR1C3P42330 323 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 EDDM3BP56851 147 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 POU2AF1Q16633 256 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 Q5PR19 223 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 VHLLQ6RSH7 139 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 LCN15Q6UWW0 184 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.67□□□□□ -1.02
GMPPA-212ENST00000496536 DDB2Q92466 427 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms