RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.69□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.69□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 MMP26Q9NRE1 261 aa8.69□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM140Q9NV12 185 aa8.69□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.69□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.69□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.69□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 U3KQ87 197 aa8.69□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 LEUTXA8MZ59 168 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 H7C2Y5 167 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 SHOXO15266 292 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TOX4O94842 621 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 NXPH3O95157 252 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 IFNA7P01567 189 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 HTR1DP28221 377 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 CEACAM3P40198 252 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB13P51153 203 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 PAX9P55771 341 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TAS2R30P59541 319 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RELBQ01201 579 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TNFRSF9Q07011 255 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 KLRD1Q13241 179 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2C3Q8N628 320 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 OR52E5Q8NH55 327 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RPEQ96AT9 228 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM8Q96KF7 97 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RBKSQ9H477 322 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 DPM3Q9P2X0 92 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.68□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 LY86O95711 162 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM50AO95807 157 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV1-16P04430 117 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2KP61086 200 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 PAX8Q06710 450 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 OR4A47Q6IF82 309 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF429Q86V71 674 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 HARBI1Q96MB7 349 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TBX15Q96SF7 602 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 BET1LQ9NYM9 111 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 IGSF23A1L1A6 192 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 C15orf61A6NNL5 157 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 OOSP1A8MZH6 123 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 UPK2O00526 184 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 IAPPP10997 89 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 LGALS7P47929 136 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 CAV2P51636 162 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 SPCS3P61009 180 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 BAXQ07812 192 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 MOB3BQ86TA1 216 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 OR8H3Q8N146 312 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 OR4A5Q8NH83 315 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 STOML3Q8TAV4 291 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 ST8SIA2Q92186 375 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 C1orf159Q96HA4 380 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 PSENENQ9NZ42 101 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 FBXL17Q9UF56 701 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 PRNDQ9UKY0 176 aa8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PPI3 338 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.65□□□□□ -1.02
ECHDC3-204ENST00000495787 IFNA17P01571 189 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms