RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 C17orf98A8MV24 154 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 A8MXK9 166 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 B4DSR2 109 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HSD17B6O14756 317 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IFNA6P05013 189 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR8U9P0C7N5 309 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 AKAIN1P0CW23 69 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR5H8P0DN80 308 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DS4P43632 304 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP10-12P60413 245 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ACTBP60709 375 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ACTG1P63261 375 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PAX5Q02548 391 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PAX8Q06710 450 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BAMBIQ13145 260 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DS1Q14954 304 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MORN2Q502X0 79 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 Q75L30 129 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM17Q86X19 198 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 STPG4Q8N801 248 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR8U1Q8NH10 309 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C17orf50Q8WW18 174 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 LHX4Q969G2 390 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BORCS5Q969J3 196 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TOMM40LQ969M1 308 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM186Q96B77 213 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TBX15Q96SF7 602 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC32Q9BV29 185 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BEX2Q9BXY8 128 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SIRPDQ9H106 197 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BEX1Q9HBH7 125 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PSG11Q9UQ72 335 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZANQ9Y493 2812 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 C5orf52A6NGY3 159 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DISC1C4P0D8 188 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TOR1AO14656 332 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ST8SIA3O43173 380 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LYRM1O43325 122 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TNFSF12O43508 249 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 GPR137BO60478 399 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 PPYP01298 95 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CD74P04233 296 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ARG1P05089 322 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB25P24278 435 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 BTCP35070 178 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 REG1BP48304 166 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RAB25P57735 213 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 TAS2R46P59540 309 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HERV-K104P61576 105 aa3.77□□□□□ -1.81
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PTPRC-211ENST00000484135 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 HCP5Q6MZN7 132 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZS49 121 aa3.77□□□□□ -1.81
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