RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R31P59538 309 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 IL18Q14116 193 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 C10orf55Q5SWW7 151 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 LPCAT3Q6P1A2 487 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 CMTM1Q8IZ96 169 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 TMEM229BQ8NBD8 167 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 MCFD2Q8NI22 146 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 PHB2Q99623 299 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RSRP1Q9BUV0 290 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RABL2BQ9UNT1 228 aa16.24■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 ACTL6BO94805 426 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 BRI3O95415 125 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 APELAP0DMC3 54 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 TBPP20226 339 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 F2RP25116 425 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF8P32971 234 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 TPPP2P59282 170 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 POU2AF1Q16633 256 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 OR4A47Q6IF82 309 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 LHFPL1Q86WI0 220 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 OR4D10Q8NGI6 311 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 OR1N2Q8NGR9 330 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SMIM4Q8WVI0 70 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SOSTQ9BQB4 213 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA2Q9HB19 425 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 BET1LQ9NYM9 111 aa16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 S1PR2O95136 353 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 TRGV3P03979 118 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 IFNA6P05013 189 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 NQO2P16083 231 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R19P59542 299 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 PHLDA2Q53GA4 152 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 FOXB2Q5VYV0 432 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 ARRDC1Q8N5I2 433 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.22■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 E7EUB6 86 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-11P01762 117 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 MAS1LP35410 378 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RAB25P57735 213 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 RPL8P62917 257 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 ZNF585BQ52M93 769 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 OR4A5Q8NH83 315 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SPIN2AQ99865 258 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 COMMD9Q9P000 198 aa16.21■□□□□ 0.19
ACTB-211ENST00000480301 TRAV3A0A0B4J244 114 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GW64 132 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 TEX22C9J3V5 150 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 RAB3DO95716 219 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 OR9G9P0C7N8 305 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 LPAR6P43657 344 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 ZNF616Q08AN1 781 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 STEAP1BQ6NZ63 245 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 TTC9CQ8N5M4 171 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 COA4Q9NYJ1 87 aa16.2■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 HMX3A6NHT5 357 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 UPK2O00526 184 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 MPPED1O15442 326 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 ZNF735P0CB33 412 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 MYOD1P15172 320 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 HLA-GP17693 338 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D26Q86UD7 250 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 HRASLSQ9HDD0 168 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 TMEM140Q9NV12 185 aa16.19■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WW49 117 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 FABP12A6NFH5 140 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 CGB1A6NKQ9 187 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 LINC01619G3V211 115 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 OR8U8P0C7N1 319 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 RPA2P15927 270 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 DMBX1Q8NFW5 382 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 TERB2Q8NHR7 220 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 DPF1Q92782 380 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A9Q9NRM0 540 aa16.18■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 MARCH11A6NNE9 402 aa16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 S100GP29377 79 aa16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 DEFA5Q01523 94 aa16.17■□□□□ 0.18
ACTB-211ENST00000480301 ZNF45Q02386 682 aa16.17■□□□□ 0.18
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