RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 OR2C3Q8N628 320 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 AUP1Q9Y679 476 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 PDZD2O15018 2839 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 C4BPBP20851 252 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 LINC01356Q8N9X3 169 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 ZDHHC16Q969W1 377 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 AJUBAQ96IF1 538 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 AIFM2Q9BRQ8 373 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 C7orf69Q9H7B7 122 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 TNCP24821 2201 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 AARDQ4LEZ3 155 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 PIP4P2Q8N4L2 257 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 CFHR4Q92496 578 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 RAB40CQ96S21 281 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 H3BP45 60 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 UPK2O00526 184 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 IFNA17P01571 189 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 MYOD1P15172 320 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 OR8H3Q8N146 312 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 BET1LQ9NYM9 111 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXB3-207ENST00000472863 C15orf61A6NNL5 157 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 CD24P25063 80 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 CNTFRP26992 372 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 SAA4P35542 130 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 NHLH2Q02577 135 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 SLA2Q9H6Q3 261 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 CR1P17927 2039 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 TRAV20A0A0B4J274 112 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 IGSF23A1L1A6 192 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 BCL2L11O43521 198 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 GPR137BO60478 399 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM14BQ9NUH8 114 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 NPFFO15130 113 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 MED6O75586 246 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 LGALS7P47929 136 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 GPR157Q5UAW9 335 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF429Q86V71 674 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM252Q8N6L7 170 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 PSENENQ9NZ42 101 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 WSB1Q9Y6I7 421 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 SLC25A17O43808 307 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 KBTBD11O94819 623 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 VENTXO95231 258 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXB3-207ENST00000472863 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXB3-207ENST00000472863 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 OR8H1Q8NGG4 311 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 DTD1Q8TEA8 209 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 MALSU1Q96EH3 234 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 SMIM3Q9BZL3 60 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-207ENST00000472863 ZANQ9Y493 2812 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TRAV40A0A0B4J280 105 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TGFAP01135 160 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 OPN1MWP04001 364 aa22.08■■□□□ 1.12
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HOXB3-207ENST00000472863 OPN1MW3P0DN78 364 aa22.08■■□□□ 1.12
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HOXB3-207ENST00000472863 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
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HOXB3-207ENST00000472863 FBLN7Q53RD9 439 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 WFDC11Q8NEX6 87 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 OR52E5Q8NH55 327 aa22.08■■□□□ 1.12
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HOXB3-207ENST00000472863 OR51B2Q9Y5P1 312 aa22.08■■□□□ 1.12
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HOXB3-207ENST00000472863 TEX261Q6UWH6 196 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 CYTL1Q9NRR1 136 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 NUP50Q9UKX7 468 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 PRNDQ9UKY0 176 aa22.07■■□□□ 1.12
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HOXB3-207ENST00000472863 IGKV1D-33P01593 117 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 IGKV1-33P01594 117 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 IGHV1-69P01742 117 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 IGHV4-31P0DP07 118 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM249Q2WGJ8 235 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 SPANXN5Q5MJ07 72 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 BRD3OSQ6XYD6 125 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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