RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468475.1

POLR1B-211, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1B, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-211ENST00000468475 DCKP27707 260 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 ZNF846Q147U1 533 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 CDK10Q15131 360 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 TNXAQ16473 311 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 RAB12Q6IQ22 244 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.07□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 TMEM80Q96HE8 168 aa5.07□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.07□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.06□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 FAM25CB3EWG5 89 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 FAM25GB3EWG6 89 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 J3QRK9 145 aa5.06□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 PROP1O75360 226 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 CLEC3BP05452 202 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 HSD17B1P14061 328 aa5.06□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 CCR9P51686 369 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 VBP1P61758 197 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 ICAM4Q14773 271 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 HMGN3Q15651 99 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 PRSS8Q16651 343 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 TP53I3Q53FA7 332 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 AADACL4Q5VUY2 407 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.06□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.06□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 SPP1P10451 314 aa5.05□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 STHQ8IWL8 128 aa5.05□□□□□ -1.6
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POLR1B-211ENST00000468475 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 CXorf58Q96LI9 332 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 OR14A2Q96R54 314 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 MAGIXQ9H6Y5 334 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 UBE2QL1A1L167 161 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 ZNF98A6NK75 572 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-211ENST00000468475 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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