RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SSX7Q7RTT5 188 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 LFNGQ8NES3 379 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 OR4S2Q8NH73 311 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF714Q96N38 554 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 DYNLRB1Q9NP97 96 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 BET1LQ9NYM9 111 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 A6NNC1 897 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FNDC10F2Z333 226 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LY6LH3BQJ8 138 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 J3QR06 171 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 LYG1Q8N1E2 194 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SVBPQ8N300 66 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CLDND2Q8NHS1 167 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SUN5Q8TC36 379 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CCL17Q92583 94 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF14Q92956 283 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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