RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 KBTBD11O94819 623 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NDUFA7O95182 113 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 KRASP01116 189 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV1-5P01602 117 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 HLA-DRB1P01911 266 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SERPINE2P07093 398 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RPA2P15927 270 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 G6PCP35575 357 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 DHRS2Q13268 280 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 OR4A47Q6IF82 309 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 LIN54Q6MZP7 749 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SSX9Q7RTT3 188 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 CADM3Q8N126 398 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SEC22AQ96IW7 307 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM140Q9NV12 185 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.11□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0G2JRQ6 117 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 OR2A4O95047 310 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 CA2P00918 260 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 P0C879 139 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 HKR1P10072 659 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ANXA3P12429 323 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RAG2P55895 527 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RAB25P57735 213 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ERVK-16P61578 105 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PLGLAQ15195 96 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PRSS8Q16651 343 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 C4orf46Q504U0 113 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PLET1Q6UQ28 207 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 LYG2Q86SG7 212 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 IL22RA2Q969J5 263 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 OR2A7Q96R45 310 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 CLCC1Q96S66 551 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 C16orf95Q9H693 158 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 BET1LQ9NYM9 111 aa8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01548A6NM66 108 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 UPK2O00526 184 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 IGHG2P01859 326 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 OR9G9P0C7N8 305 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RIPPLY3P57055 190 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 CX3CL1P78423 397 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SRPXP78539 464 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 NDPQ00604 133 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 RGS21Q2M5E4 152 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF695Q8IW36 515 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 LGI3Q8N145 548 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SLC35G3Q8N808 338 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 LRTM2Q8N967 370 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 OR4A5Q8NH83 315 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.09□□□□□ -1.11
GARNL3-211ENST00000460176 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 ATG12O94817 140 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 IL5P05113 134 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 FGF2P09038 288 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 AKR1C2P52895 323 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 MMD2Q8IY49 270 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 OR4F5Q8NH21 305 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01006Q8NI28 216 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 MITD1Q8WV92 249 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 OR51J1Q9H342 316 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.08□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0B4J293 547 aa8.07□□□□□ -1.12
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0B4J2A0 478 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms