RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445961.5

RPS9-208, Transcript of ribosomal protein S9, human

TSL 5

Gene RPS9, Length 944 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS9-208	ENST00000445961	PRH1	P02810	166 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	GNG2	P59768	71 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	PRSS8	Q16651	343 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	MPPED1	O15442	326 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	FCER2	P06734	321 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	PTHLH	P12272	177 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ZP3	P21754	424 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SYNJ2BP	P57105	145 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	IGLV1-51	P01701	117 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	IL18	Q14116	193 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	CDK10	Q15131	360 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	HMX3	A6NHT5	357 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	UPK1B	O75841	260 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	AADAC	P22760	399 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	RHOG	P84095	191 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961		Q8N1Y9	231 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	RCHY1	Q96PM5	261 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ACTL6B	O94805	426 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	BRI3	O95415	125 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	DEFA1	P59665	94 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	DEFA3	P59666	94 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	AP3S2	P59780	193 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF79	Q15937	498 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	MMD2	Q8IY49	270 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961		Q8N402	240 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	USMG5	Q96IX5	58 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961		E7EUB6	86 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	TNFSF12	O43508	249 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SLC22A5	O76082	557 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	CSN3	P07498	182 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	CBX5	P45973	191 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ARPC4	P59998	168 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	ATP5G2	Q06055	141 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	PYDC2	Q56P42	97 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RPS9-208	ENST00000445961	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	BMPR1B	O00238	502 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	OR2J3	O76001	311 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	KBTBD11	O94819	623 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	OR2A4	O95047	310 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	MYOD1	P15172	320 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	FCGR2C	P31995	323 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	PRSS3	P35030	304 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	TAS2R20	P59543	309 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RPS9-208	ENST00000445961	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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