RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442201.6

CCDC39-201, Transcript of coiled-coil domain containing 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC39, Length 3,279 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-201ENST00000442201 MITD1Q8WV92 249 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 NINJ1Q92982 152 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 TP53RKQ96S44 253 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 PHB2Q99623 299 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 PPP5D1E7EU14 171 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SFT2D2O95562 160 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 VPS25Q9BRG1 176 aa6.69□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 FLNCQ14315 2725 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 MMP23AO75900 390 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 FSTL3O95633 263 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CR1LQ2VPA4 569 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 DYSFO75923 2080 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 UMAD1C9J7I0 102 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 C15orf65H3BRN8 121 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.68□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 ZNF616Q08AN1 781 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 TIMD4Q96H15 378 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 hADV38S2A0JD32 116 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 LY6HO94772 140 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 S100GP29377 79 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 S100A7P31151 101 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CDKN1AP38936 164 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 ERVFRD-1P60508 538 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 UBE2G2P60604 165 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 PSG3Q16557 428 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 PRSS8Q16651 343 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 OR1P1Q8NH06 330 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 RAB1CQ92928 201 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CALYQ9NYX4 217 aa6.68□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 A0A0B4J2A0 478 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CYB5BO43169 146 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 OR8U9P0C7N5 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 FHITP49789 147 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 NAA60Q9H7X0 242 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 GNG12Q9UBI6 72 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 HSD17B6O14756 317 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 ARV1Q9H2C2 271 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CTSZQ9UBR2 303 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 JPT1Q9UK76 154 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 MPPED1O15442 326 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CGB3P0DN86 165 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CGB7P0DN87 165 aa6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 RND3P61587 244 aa6.67□□□□□ -1.34
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