RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQD3 144 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 H0Y980 276 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35B1P78383 322 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC21Q5SSG8 566 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 ASCL4Q6XD76 172 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SIRPDQ9H106 197 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 IL36BQ9NZH7 164 aa7.06□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 GNG7O60262 68 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR7C2O60412 319 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCD6O75340 191 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN15P56746 228 aa7.06□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.06□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 OOSP2Q86WS3 158 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf159Q96HA4 380 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPB6O14558 160 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE6DO43924 150 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV3-1P01715 115 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 COX5AP20674 150 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 F2RP25116 425 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SRIP30626 198 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS4P56470 323 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC61GP60059 68 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 PMCHL1Q16048 86 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR13H1Q8NG92 308 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 TAAR6Q96RI8 345 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX1O43812 170 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN1O95832 211 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYBA4P53673 196 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 PSG7Q13046 419 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2M7Q8NG81 312 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 TSKUQ8WUA8 353 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 BORCS8Q96FH0 119 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX5Q96PT3 197 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.04□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR8B8Q15620 311 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 MMD2Q8IY49 270 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.04□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 GJE1A6NN92 205 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R1X1 148 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 DEGS1O15121 323 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 CNIH1O95406 144 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV3-11P04433 115 aa7.04□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB125Q8N687 156 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF785A8K8V0 405 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1-39P01597 117 aa7.04□□□□□ -1.28
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RABGEF1-203ENST00000439720 TGFBR3Q03167 851 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 RBPJQ06330 500 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST3H3Q16695 136 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 RPEL1Q2QD12 228 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 FADS6Q8N9I5 356 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1L1Q8NH94 360 aa7.04□□□□□ -1.28
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