RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-209ENST00000439106 OR2A7Q96R45 310 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-209ENST00000439106 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-209ENST00000439106 TRAV3A0A0B4J244 114 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 TMEM127O75204 238 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 OR2J3O76001 311 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 IGHV3-23P01764 117 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 AREGP15514 252 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RPA2P15927 270 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 HERV-K104P61576 105 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.58□□□□□ -0.72
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PRAME-209ENST00000439106 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa10.58□□□□□ -0.72
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PRAME-209ENST00000439106 CGB1A6NKQ9 187 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 S1PR2O95136 353 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 BRI3O95415 125 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 REG1AP05451 166 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ZP3P21754 424 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DMAP28067 261 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 OR4A47Q6IF82 309 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 SNX29P2Q8IUI4 249 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 GIMAP1Q8WWP7 306 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 USMG5Q96IX5 58 aa10.57□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 PPP5D1E7EU14 171 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 BMPR1BO00238 502 aa10.56□□□□□ -0.72
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PRAME-209ENST00000439106 IGLV1-51P01701 117 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RLN1P04808 185 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ELK1P19419 428 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 EDN2P20800 178 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 GNRHRP30968 328 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 PRSS3P35030 304 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 HRH1P35367 487 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 KIR2DS2P43631 304 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ATP5G2Q06055 141 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 CATR1Q13166 79 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 MSMO1Q15800 293 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RPEL1Q2QD12 228 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 OR9G4Q8NGQ1 327 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 OR5H2Q8NGV7 314 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ELOVL1Q9BW60 279 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 HRASLSQ9HDD0 168 aa10.56□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 DPPA5A6NC42 116 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FAM223BA6NKX1 122 aa10.55□□□□□ -0.72
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF735P0CB33 412 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 NAT1P18440 290 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 C15orf32Q32M92 178 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 MOB3AQ96BX8 217 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 TMEM140Q9NV12 185 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 BET1LQ9NYM9 111 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 GABARAPO95166 117 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 NDUFB8O95169 186 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 HPRT1P00492 218 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 CSN3P07498 182 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 HLA-GP17693 338 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 TAS2R46P59540 309 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RYR3Q15413 4870 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 CTF1Q16619 201 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 SBSPONQ8IVN8 264 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 NECAP1Q8NC96 275 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 DMBX1Q8NFW5 382 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 GPX8Q8TED1 209 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 CCDC140Q96MF4 163 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 SLC2A9Q9NRM0 540 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 SELENOKQ9Y6D0 94 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 U3KQK5 164 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FAM25AB3EWG3 89 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FAM25CB3EWG5 89 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 FAM25GB3EWG6 89 aa10.53□□□□□ -0.72
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