RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 NEURL1O76050 574 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 ABHD17BQ5VST6 288 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 CBY1Q9Y3M2 126 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 MGAQ8IWI9 3026 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 J3QT63 122 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 RAB7AP51149 207 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 OR8I2Q8N0Y5 310 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 DCTN5Q9BTE1 182 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 LRFN3Q9BTN0 628 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 KCNIP2Q9NS61 270 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 KCNIP1Q9NZI2 227 aa12.86□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 TMPRSS2O15393 492 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 MAGEA5P43359 124 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM164Q5U3C3 297 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 LINC00596Q86U02 117 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 GALMQ96C23 342 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 PSG11Q9UQ72 335 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 OR5B21A6NL26 309 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 HBZP02008 142 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 CELA3BP08861 270 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 OR9G9P0C7N8 305 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 SSTR5P35346 364 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 GABRA2P47869 451 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 RPL31P62899 125 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 PRR31Q5SQ13 230 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 ABHD12Q8N2K0 398 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 DIRC3C9JPN6 131 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 CHRNB4P30926 498 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 COMPP49747 757 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 GFRA1P56159 465 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 FXYD3Q14802 87 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 NINJ1Q92982 152 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 GNB4Q9HAV0 340 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 MPC1Q9Y5U8 109 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 TNFSF15O95150 251 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 CD99P14209 185 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 PAFAH1B2P68402 229 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 APH1AQ96BI3 265 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 ACTL6BO94805 426 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 OR1C1Q15619 314 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 STPG4Q8N801 248 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 OR2M7Q8NG81 312 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 UHRF2Q96PU4 802 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 MS4A5Q9H3V2 200 aa12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
SFRP4-201ENST00000436072 P0C879 139 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 HTD2P86397 168 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 CATR1Q13166 79 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 MAJINQ3KP22 176 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 SPATA45Q537H7 98 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 RCHY1Q96PM5 261 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 WDR83OSQ9Y284 106 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 HAND1O96004 215 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 AMTP48728 403 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 HES3Q5TGS1 186 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 MOB1BQ7L9L4 216 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 MDP1Q86V88 176 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 NAT8BQ9UHF3 227 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa12.83□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 FCGR3BO75015 233 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 PLGLB1Q02325 96 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 TREML4Q6UXN2 200 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZR03 302 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 DOLPP1Q86YN1 238 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 MGST2Q99735 147 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 TXN2Q99757 166 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 IL36BQ9NZH7 164 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 GAGE1Q13065 139 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 MMD2Q8IY49 270 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 ZPBPQ9BS86 351 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 RTL8AQ9BWD3 113 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 SPRY4Q9C004 299 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 METRNQ9UJH8 293 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA1GO43497 2377 aa12.82□□□□□ -0.36
SFRP4-201ENST00000436072 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.7 ms