RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 GNB3P16520 340 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP5-9P26371 169 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 HTR5AP47898 357 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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PTPRK-211ENST00000429595 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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PTPRK-211ENST00000429595 C1orf123Q9NWV4 160 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRK-211ENST00000429595 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-211ENST00000429595 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRK-211ENST00000429595 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRK-211ENST00000429595 ATG12O94817 140 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 IFNA21P01568 189 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 SEC11BP0C7V7 166 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 AKR1C4P17516 323 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 TUBG1P23258 451 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-211ENST00000429595 CDAP32320 146 aa4.82□□□□□ -1.64
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